Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18528 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P18528 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18528 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P18528 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18528 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18528 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18528 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18528 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P18528 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18528 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18528 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18528 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18528 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18528 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18528 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18528 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18528 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18528 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18528 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18528 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P18528 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18528 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18528 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18528 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18528 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18528 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18528 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18528 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18528 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18528 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18528 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18528 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18528 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18528 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18528 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18528 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18528 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18528 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18528 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18528 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18528 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18528 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18528 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18528 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18528 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18528 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18528 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18528 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18528 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18528 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18528 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P18528 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18528 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18528 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18528 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18528 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18528 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18528 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18528 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18528 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18528 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P18528 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P18528 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18528 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18528 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18528 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18528 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18528 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18528 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18528 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18528 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18528 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18528 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18528 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18528 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18528 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18528 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P18528 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms