Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgfb3P17125 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms