Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcna3P16390 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcna3P16390 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcna3P16390 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms