Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rag1P15919 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rag1P15919 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rag1P15919 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rag1P15919 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Rag1P15919 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rag1P15919 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rag1P15919 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rag1P15919 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rag1P15919 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rag1P15919 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rag1P15919 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rag1P15919 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rag1P15919 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rag1P15919 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rag1P15919 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rag1P15919 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rag1P15919 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rag1P15919 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rag1P15919 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rag1P15919 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rag1P15919 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rag1P15919 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rag1P15919 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms