Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf1P15314 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Irf1P15314 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf1P15314 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irf1P15314 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms