Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmnb1P14733 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmnb1P14733 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms