Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd5P13379 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd5P13379 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms