Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb1P13372 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms