Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cntn1P12960 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cntn1P12960 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms