Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms