Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb1P12658 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb1P12658 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb1P12658 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb1P12658 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb1P12658 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb1P12658 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Calb1P12658 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms