Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd1d1P11609 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd1d1P11609 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms