Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PolP11369 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PolP11369 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PolP11369 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PolP11369 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PolP11369 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PolP11369 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PolP11369 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PolP11369 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PolP11369 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PolP11369 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PolP11369 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PolP11369 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PolP11369 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PolP11369 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PolP11369 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PolP11369 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PolP11369 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PolP11369 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PolP11369 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PolP11369 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PolP11369 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PolP11369 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PolP11369 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PolP11369 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PolP11369 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PolP11369 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PolP11369 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PolP11369 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PolP11369 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PolP11369 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PolP11369 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PolP11369 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PolP11369 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PolP11369 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PolP11369 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PolP11369 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PolP11369 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PolP11369 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PolP11369 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PolP11369 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PolP11369 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PolP11369 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PolP11369 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PolP11369 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PolP11369 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PolP11369 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PolP11369 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PolP11369 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PolP11369 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PolP11369 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PolP11369 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PolP11369 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PolP11369 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PolP11369 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PolP11369 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PolP11369 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PolP11369 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PolP11369 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PolP11369 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PolP11369 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PolP11369 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PolP11369 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PolP11369 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PolP11369 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PolP11369 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PolP11369 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PolP11369 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PolP11369 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PolP11369 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PolP11369 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PolP11369 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PolP11369 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PolP11369 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PolP11369 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PolP11369 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PolP11369 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PolP11369 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PolP11369 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PolP11369 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PolP11369 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PolP11369 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PolP11369 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PolP11369 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PolP11369 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PolP11369 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PolP11369 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PolP11369 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PolP11369 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PolP11369 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PolP11369 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PolP11369 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PolP11369 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PolP11369 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PolP11369 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PolP11369 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PolP11369 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PolP11369 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PolP11369 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PolP11369 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms