Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P10404 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P10404 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P10404 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P10404 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P10404 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P10404 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P10404 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P10404 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P10404 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P10404 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P10404 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P10404 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P10404 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P10404 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P10404 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P10404 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P10404 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P10404 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P10404 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P10404 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P10404 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P10404 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P10404 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P10404 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P10404 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P10404 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P10404 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P10404 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P10404 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P10404 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P10404 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P10404 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P10404 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P10404 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P10404 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P10404 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P10404 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P10404 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P10404 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P10404 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P10404 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P10404 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P10404 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P10404 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P10404 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P10404 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P10404 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P10404 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P10404 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P10404 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P10404 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P10404 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P10404 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P10404 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P10404 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P10404 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P10404 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P10404 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P10404 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P10404 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P10404 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P10404 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P10404 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P10404 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P10404 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P10404 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P10404 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P10404 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P10404 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P10404 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P10404 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P10404 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P10404 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P10404 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P10404 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P10404 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P10404 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P10404 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P10404 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P10404 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P10404 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P10404 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P10404 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P10404 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P10404 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P10404 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P10404 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P10404 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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