Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP10400 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP10400 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP10400 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PolP10400 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolP10400 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolP10400 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolP10400 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolP10400 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolP10400 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolP10400 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolP10400 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PolP10400 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP10400 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP10400 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP10400 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP10400 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP10400 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP10400 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP10400 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP10400 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP10400 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP10400 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP10400 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PolP10400 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PolP10400 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolP10400 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP10400 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP10400 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP10400 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP10400 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP10400 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP10400 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP10400 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP10400 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP10400 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP10400 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP10400 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolP10400 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP10400 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP10400 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP10400 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP10400 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP10400 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP10400 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP10400 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP10400 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP10400 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP10400 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolP10400 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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