Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Amd1P0DMN7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms