Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3P09920 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3P09920 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3P09920 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csf3P09920 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms