Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna9P09235 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms