Protein–RNA interactions for Protein: P08883

Gzmf, Granzyme F, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmfP08883 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GzmfP08883 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GzmfP08883 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GzmfP08883 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GzmfP08883 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GzmfP08883 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GzmfP08883 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GzmfP08883 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GzmfP08883 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GzmfP08883 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GzmfP08883 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GzmfP08883 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GzmfP08883 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmfP08883 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmfP08883 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmfP08883 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmfP08883 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmfP08883 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmfP08883 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmfP08883 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmfP08883 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GzmfP08883 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms