Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egr1P08046 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egr1P08046 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egr1P08046 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Egr1P08046 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Egr1P08046 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Egr1P08046 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Egr1P08046 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms