Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Spta1P08032 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spta1P08032 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spta1P08032 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Spta1P08032 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spta1P08032 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Spta1P08032 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spta1P08032 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spta1P08032 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spta1P08032 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spta1P08032 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spta1P08032 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spta1P08032 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spta1P08032 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms