Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Prm2P07978 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Prm2P07978 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Prm2P07978 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms