Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna6P07350 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms