Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06344 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06344 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06344 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P06344 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06344 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06344 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06344 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06344 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06344 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06344 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06344 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06344 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P06344 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06344 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06344 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06344 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06344 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06344 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P06344 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06344 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06344 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06344 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06344 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06344 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06344 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06344 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06344 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06344 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06344 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06344 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06344 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06344 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06344 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P06344 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06344 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06344 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06344 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06344 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06344 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06344 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06344 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06344 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06344 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P06344 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P06344 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06344 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06344 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P06344 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06344 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06344 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06344 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06344 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06344 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P06344 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06344 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06344 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06344 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06344 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06344 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P06344 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06344 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06344 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06344 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06344 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06344 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P06344 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P06344 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06344 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06344 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06344 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06344 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06344 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06344 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06344 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06344 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06344 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06344 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06344 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06344 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06344 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06344 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06344 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06344 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06344 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06344 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P06344 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06344 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06344 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06344 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06344 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06344 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06344 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06344 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06344 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06344 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06344 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06344 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06344 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06344 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms