Protein–RNA interactions for Protein: P05366

Saa1, Serum amyloid A-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa1P05366 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa1P05366 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa1P05366 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa1P05366 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa1P05366 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa1P05366 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa1P05366 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa1P05366 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa1P05366 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa1P05366 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa1P05366 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms