Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms