Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GzmbP04187 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GzmbP04187 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GzmbP04187 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GzmbP04187 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GzmbP04187 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GzmbP04187 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GzmbP04187 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms