Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxa7P02830 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxa7P02830 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms