Protein–RNA interactions for Protein: P01783

Ig heavy chain V region MOPC 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01783 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01783 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01783 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01783 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01783 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01783 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01783 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01783 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01783 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01783 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01783 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01783 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01783 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01783 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01783 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01783 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01783 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01783 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01783 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01783 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01783 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01783 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01783 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01783 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01783 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01783 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01783 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01783 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01783 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01783 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01783 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01783 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01783 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01783 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01783 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01783 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01783 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01783 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01783 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01783 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01783 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01783 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01783 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01783 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01783 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01783 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01783 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01783 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01783 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01783 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01783 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01783 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01783 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01783 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01783 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01783 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01783 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01783 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01783 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01783 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01783 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01783 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01783 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01783 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01783 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01783 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01783 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01783 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01783 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01783 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01783 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01783 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01783 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01783 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01783 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01783 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01783 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01783 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01783 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01783 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01783 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01783 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01783 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01783 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01783 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01783 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01783 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01783 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01783 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01783 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01783 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01783 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01783 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01783 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01783 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01783 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01783 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01783 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01783 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01783 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms