Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01672 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01672 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01672 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01672 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01672 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01672 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01672 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01672 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01672 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01672 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01672 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01672 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01672 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01672 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01672 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01672 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01672 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01672 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01672 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01672 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01672 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01672 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
P01672 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01672 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01672 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01672 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01672 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
P01672 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01672 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01672 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01672 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01672 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
P01672 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01672 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01672 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01672 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01672 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01672 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
P01672 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01672 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01672 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01672 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01672 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01672 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01672 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01672 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01672 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01672 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01672 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01672 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01672 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01672 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01672 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01672 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01672 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
P01672 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01672 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01672 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01672 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01672 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01672 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01672 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01672 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01672 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01672 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01672 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01672 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01672 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01672 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01672 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01672 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01672 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01672 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01672 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01672 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01672 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01672 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01672 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01672 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01672 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01672 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01672 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01672 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01672 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01672 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01672 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01672 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01672 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01672 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01672 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01672 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01672 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01672 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01672 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01672 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01672 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01672 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01672 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01672 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms