Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01658 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01658 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01658 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01658 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01658 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01658 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01658 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01658 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01658 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01658 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01658 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01658 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01658 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01658 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01658 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01658 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01658 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01658 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01658 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01658 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01658 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01658 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01658 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01658 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01658 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01658 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01658 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01658 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01658 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01658 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01658 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01658 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01658 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01658 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01658 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01658 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01658 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01658 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01658 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01658 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01658 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01658 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01658 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01658 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01658 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01658 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01658 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01658 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01658 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01658 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01658 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01658 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01658 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01658 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01658 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01658 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01658 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01658 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01658 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01658 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01658 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01658 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01658 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01658 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01658 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01658 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01658 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01658 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01658 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01658 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01658 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01658 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01658 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01658 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms