Protein–RNA interactions for Protein: P01193

Pomc, Pro-opiomelanocortin, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomcP01193 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PomcP01193 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PomcP01193 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PomcP01193 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PomcP01193 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PomcP01193 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PomcP01193 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PomcP01193 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PomcP01193 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PomcP01193 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PomcP01193 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PomcP01193 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PomcP01193 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PomcP01193 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PomcP01193 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PomcP01193 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PomcP01193 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PomcP01193 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PomcP01193 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PomcP01193 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PomcP01193 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PomcP01193 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PomcP01193 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PomcP01193 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PomcP01193 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PomcP01193 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PomcP01193 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PomcP01193 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PomcP01193 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PomcP01193 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PomcP01193 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PomcP01193 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PomcP01193 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PomcP01193 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PomcP01193 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PomcP01193 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PomcP01193 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PomcP01193 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PomcP01193 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PomcP01193 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PomcP01193 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PomcP01193 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PomcP01193 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PomcP01193 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PomcP01193 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PomcP01193 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PomcP01193 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PomcP01193 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PomcP01193 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PomcP01193 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PomcP01193 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PomcP01193 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PomcP01193 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PomcP01193 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PomcP01193 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PomcP01193 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PomcP01193 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PomcP01193 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PomcP01193 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PomcP01193 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PomcP01193 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PomcP01193 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PomcP01193 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PomcP01193 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PomcP01193 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PomcP01193 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PomcP01193 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PomcP01193 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PomcP01193 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PomcP01193 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PomcP01193 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PomcP01193 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PomcP01193 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PomcP01193 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PomcP01193 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PomcP01193 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PomcP01193 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PomcP01193 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PomcP01193 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PomcP01193 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PomcP01193 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms