Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abl1P00520 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abl1P00520 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abl1P00520 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abl1P00520 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abl1P00520 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abl1P00520 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abl1P00520 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abl1P00520 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abl1P00520 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abl1P00520 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abl1P00520 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms