Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda1O88958 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda1O88958 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda1O88958 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda1O88958 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda1O88958 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda1O88958 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda1O88958 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda1O88958 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda1O88958 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda1O88958 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda1O88958 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda1O88958 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gnpda1O88958 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnpda1O88958 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnpda1O88958 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnpda1O88958 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnpda1O88958 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnpda1O88958 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnpda1O88958 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnpda1O88958 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gnpda1O88958 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gnpda1O88958 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms