Protein–RNA interactions for Protein: O88848

Arl6, ADP-ribosylation factor-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6O88848 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6O88848 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arl6O88848 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arl6O88848 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arl6O88848 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arl6O88848 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms