Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CntfrO88507 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntfrO88507 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntfrO88507 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CntfrO88507 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CntfrO88507 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntfrO88507 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CntfrO88507 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CntfrO88507 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntfrO88507 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CntfrO88507 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
CntfrO88507 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CntfrO88507 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntfrO88507 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CntfrO88507 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntfrO88507 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntfrO88507 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CntfrO88507 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CntfrO88507 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfrO88507 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfrO88507 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfrO88507 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfrO88507 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfrO88507 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfrO88507 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CntfrO88507 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CntfrO88507 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfrO88507 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfrO88507 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CntfrO88507 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfrO88507 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfrO88507 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfrO88507 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfrO88507 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfrO88507 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfrO88507 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CntfrO88507 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CntfrO88507 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfrO88507 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfrO88507 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CntfrO88507 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CntfrO88507 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CntfrO88507 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CntfrO88507 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfrO88507 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfrO88507 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfrO88507 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfrO88507 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfrO88507 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfrO88507 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CntfrO88507 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CntfrO88507 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CntfrO88507 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntfrO88507 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CntfrO88507 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntfrO88507 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntfrO88507 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntfrO88507 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntfrO88507 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CntfrO88507 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntfrO88507 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntfrO88507 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CntfrO88507 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntfrO88507 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntfrO88507 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntfrO88507 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntfrO88507 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntfrO88507 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CntfrO88507 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntfrO88507 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CntfrO88507 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CntfrO88507 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntfrO88507 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntfrO88507 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CntfrO88507 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntfrO88507 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CntfrO88507 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CntfrO88507 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms