Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AurkcO88445 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AurkcO88445 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AurkcO88445 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AurkcO88445 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AurkcO88445 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AurkcO88445 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AurkcO88445 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AurkcO88445 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AurkcO88445 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AurkcO88445 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AurkcO88445 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AurkcO88445 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AurkcO88445 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AurkcO88445 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AurkcO88445 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AurkcO88445 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AurkcO88445 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AurkcO88445 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AurkcO88445 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AurkcO88445 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AurkcO88445 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AurkcO88445 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms