Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms