Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfdp1O88271 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms