Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Nptx2O70340 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms