Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lnx1O70263 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms