Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RngttO55236 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RngttO55236 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RngttO55236 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RngttO55236 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RngttO55236 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RngttO55236 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RngttO55236 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RngttO55236 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RngttO55236 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RngttO55236 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RngttO55236 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RngttO55236 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RngttO55236 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RngttO55236 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RngttO55236 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RngttO55236 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RngttO55236 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RngttO55236 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RngttO55236 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RngttO55236 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RngttO55236 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RngttO55236 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RngttO55236 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RngttO55236 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RngttO55236 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RngttO55236 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RngttO55236 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RngttO55236 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RngttO55236 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RngttO55236 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RngttO55236 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RngttO55236 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RngttO55236 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RngttO55236 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RngttO55236 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RngttO55236 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RngttO55236 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RngttO55236 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RngttO55236 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RngttO55236 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RngttO55236 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RngttO55236 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RngttO55236 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RngttO55236 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RngttO55236 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RngttO55236 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RngttO55236 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RngttO55236 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RngttO55236 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RngttO55236 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RngttO55236 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RngttO55236 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RngttO55236 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RngttO55236 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RngttO55236 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RngttO55236 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RngttO55236 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RngttO55236 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RngttO55236 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RngttO55236 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RngttO55236 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RngttO55236 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RngttO55236 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RngttO55236 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RngttO55236 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RngttO55236 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RngttO55236 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RngttO55236 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RngttO55236 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RngttO55236 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RngttO55236 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RngttO55236 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RngttO55236 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RngttO55236 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RngttO55236 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RngttO55236 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RngttO55236 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RngttO55236 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RngttO55236 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RngttO55236 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RngttO55236 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RngttO55236 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RngttO55236 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RngttO55236 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RngttO55236 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RngttO55236 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RngttO55236 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RngttO55236 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RngttO55236 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RngttO55236 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RngttO55236 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RngttO55236 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RngttO55236 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RngttO55236 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RngttO55236 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RngttO55236 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RngttO55236 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RngttO55236 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RngttO55236 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms