Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx4O55187 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx4O55187 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms