Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cyp26a1O55127 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26a1O55127 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms