Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dsg2O55111 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms