Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syngr1O55100 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syngr1O55100 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms