Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a2O54833 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a2O54833 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a2O54833 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a2O54833 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csnk2a2O54833 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk2a2O54833 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk2a2O54833 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk2a2O54833 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk2a2O54833 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk2a2O54833 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csnk2a2O54833 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Csnk2a2O54833 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms