Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EdaO54693 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EdaO54693 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EdaO54693 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EdaO54693 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EdaO54693 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EdaO54693 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EdaO54693 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EdaO54693 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EdaO54693 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EdaO54693 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EdaO54693 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EdaO54693 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EdaO54693 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EdaO54693 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EdaO54693 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EdaO54693 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EdaO54693 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EdaO54693 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EdaO54693 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EdaO54693 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EdaO54693 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EdaO54693 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EdaO54693 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EdaO54693 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EdaO54693 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EdaO54693 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EdaO54693 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EdaO54693 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EdaO54693 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EdaO54693 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EdaO54693 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EdaO54693 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EdaO54693 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EdaO54693 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EdaO54693 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EdaO54693 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EdaO54693 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EdaO54693 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EdaO54693 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EdaO54693 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EdaO54693 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EdaO54693 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EdaO54693 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EdaO54693 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EdaO54693 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EdaO54693 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EdaO54693 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EdaO54693 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EdaO54693 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EdaO54693 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EdaO54693 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EdaO54693 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EdaO54693 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EdaO54693 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EdaO54693 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EdaO54693 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EdaO54693 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EdaO54693 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EdaO54693 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EdaO54693 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EdaO54693 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EdaO54693 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EdaO54693 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EdaO54693 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EdaO54693 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EdaO54693 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EdaO54693 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EdaO54693 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EdaO54693 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EdaO54693 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EdaO54693 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EdaO54693 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EdaO54693 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EdaO54693 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EdaO54693 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EdaO54693 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EdaO54693 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EdaO54693 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EdaO54693 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EdaO54693 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EdaO54693 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EdaO54693 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EdaO54693 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EdaO54693 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EdaO54693 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EdaO54693 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EdaO54693 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EdaO54693 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EdaO54693 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EdaO54693 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EdaO54693 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EdaO54693 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EdaO54693 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EdaO54693 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EdaO54693 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EdaO54693 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EdaO54693 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EdaO54693 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EdaO54693 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms