Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab33bO35963 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms