Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek2O35942 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek2O35942 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek2O35942 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek2O35942 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek2O35942 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek2O35942 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek2O35942 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nek2O35942 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nek2O35942 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nek2O35942 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek2O35942 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek2O35942 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek2O35942 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek2O35942 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek2O35942 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nek2O35942 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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